В 1976 году - окончил Иркутском институте народного хозяйства, квалификация «инженер-экономист».

В 1976 году - экономиста Военно-воздушных сил на авиационном заводе в Улан-Удэ.

В конце 80-х годов Алексей Исайкин отвечал за реализацию государственного заказа самолетов Ан-124 для Военно-транспортной авиации СССР в Ульяновском авиационно-промышленном комплексе (сейчас — ЗАО «Авиастар-СП»).

В 1989 году - завершил военную карьеру и возглавил инициативную группу по созданию первой в стране частной грузовой авиакомпании.

В 1990 году - в Ульяновске создана авиакомпания «Волга‑Днепр» — первая в России негосударственная грузовая авиакомпания и первое в Ульяновской области акционерное общество.

В период с 1990 по 2002 год - занимал посты председателя правления АО «Волга-Днепр», исполнительного директора и генерального директора авиакомпании «Волга-Днепр».

С 2002 года - является президентом Группы компаний «Волга-Днепр».