1994–1996 годы – руководитель компании «Файнарт-аудит».

1996–1997 годы – председатель региональной комиссии по рынку ценных бумаг Калужской области.

1997–2001 годы – заместитель директора департамента экономики и промышленности правительства Калужской области.

2001–2004 годы – первый заместитель председателя комитета государственного имущества Калужской области.

В 2004 году – министр экономического развития Калужской области.

2004–2007 годы – первый заместитель городского головы, городской голова города Калуги.

2007–май 2012 года – заместитель губернатора Калужской области.

22 мая 2012 года назначен Заместителем Руководителя Аппарата Правительства Российской Федерации.

24 мая 2013 года назначен Первым заместителем Руководителя Аппарата Правительства Российской Федерации.

18 мая 2018 года назначен Заместителем Председателя Правительства Российской Федерации. В сферу ответственности Акимова вошли: связь, транспорт и цифровизация экономики.

С 2018 года председатель Совета директоров РЖД

Женат, имеет двоих сыновей.